幾丁質酶要存在于蝦、蟹、昆蟲等甲殼類動物的外殼與軟體動物的器官(例如烏賊的軟骨)，以及真菌類的細胞壁中。而幾丁質酶可催化幾丁質水解，具有抵御真菌侵染的作用，成為抗真菌病害的研究熱點。""